熒光原位雜交技術fish檢測中重要的因素是溫度、光照、濕度和各種試劑的PH值。溫度和濕度直接影響著探針和目標DNA的雜交效率；光照影響了熒光染料的強度；各種試劑pH是否符合要求直接關系到FISH的穩定性。

　　如何保證熒光原位雜交技術fish檢測操作中的溫度呢？

　　對于該問題*的措施是使用一些FISH的儀器進行操作。如果是手工操作，首先要對FISH操作過程中可能使用的一些儀器進行溫控能力的檢查，諸如水浴鍋、孵箱，對其中不符合要求的要進行更換（疾病診斷中的探針要求溫控精度在1度以內）。其次，要盡可能地保持操作環境溫度在20度以上，對于在冬季進行的FISH操作尤為重要。此外對于需要預熱以達到要求溫度的試劑，在使用前必須使用溫度計對其進行測溫。同時檢測的樣本不能超過4塊。操作中的行動一定要迅速。操作者還往往忽視一些小部件的溫度，諸如載玻片和蓋玻片。特別是在冬季，蓋玻片本身溫度就低，加之探針的量本就不多（10ul），因此事先沒有預熱的蓋玻片會使得雜交液的溫度急劇下降嚴重地影響了探針和目標DNA的雜交效率。因此對上述小部件的預熱也能有效地提高FISH的雜交效果。使用熒光顯微鏡觀察結果時，初有清晰而明亮的信號。但隨后信號急劇衰減。幾分鐘后信號就消失了。正常情況下，商業化探針即使是雜交后，如果保存適當，熒光信號能保持半年以上。出現上述情況主要的原因是操作觀察的過程中或是探針的保存過程中沒有采取嚴格的避光措施。陽光或是強的燈光都會使熒光染料發生急劇的淬滅，從而造成了觀察結果的不穩定。因此在操作和觀察時，盡可能在暗室中操作。也可以在封片觀察時加入一定的antifade（抗淬滅劑）以延緩熒光素的淬滅。